La division « Biologie des systèmes microbiens et sciences des aliments » est chargée de mener des études et des travaux de recherche sur:
- la valorisation de souches microbiennes autochtones à intérêt agronomique, vétérinaire et biotechnologique (bactéries, actinobactéries, champignons, microalgues) ;
- la production de biomolécules microbiennes à intérêt biotechnologique et économique (enzymes, molécules bioactives, protéines) ;
- l’exploration des interactions plantes-microorganismes dans les environnements agropastoraux (symbioses, pathosystèmes et biostimulation) ;
- la valorisation des bactéries lactiques et probiotiques issues de produits laitiers traditionnels ;
- la valorisation des produits du terroir et sous-produits steppiques à intérêt biotechnologique et agroalimentaire ;
- l’exploration bio-informatique des biomolécules à intérêt biotechnologique ainsi que des données omiques (microbiomique, génomique, transcriptomique, protéomique et métabolomique).